RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524035.5

MEG3-222, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 2,853 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035		A0A1W2PPV4	95 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035		E7EUB6	86 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	UBE2G2	P60604	165 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	RAB5B	P61020	215 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	RNF212	Q495C1	297 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM186	Q96B77	213 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	RITA1	Q96K30	269 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035		A0A087WWC5	75 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	MLANA	Q16655	118 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	IGFBP2	P18065	325 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-222	ENST00000524035	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035		Q8WTZ3	238 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	BIN3	Q9NQY0	253 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	CXCL1	P09341	107 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	B2M	P61769	119 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	ELOB	Q15370	118 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	STPG3	Q8N7X2	389 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035		A0A087X0M5	115 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035		A0A1B0GX30	115 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	AGA	P20933	346 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	AKR1D1	P51857	326 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	PARL	Q9H300	379 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	IGLV2-23	P01705	113 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	ADIRF	Q15847	76 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	SSX3	Q99909	188 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	C11orf94	C9JXX5	98 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	MAS1L	P35410	378 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	ATP5G3	P48201	142 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	CST9LP1	Q5W188	147 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	RAB1C	Q92928	201 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035		B4DEV8	164 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	SLC25A17	O43808	307 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	SOX15	O60248	233 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	NPPC	P23582	126 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	PPOX	P50336	477 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM250	H0YL14	139 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF137P	P52743	207 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-222	ENST00000524035	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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