RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 SERPINE2P07093 398 aa11.67□□□□□ -0.54
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SH3BP2-225ENST00000513069 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.67□□□□□ -0.54
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SH3BP2-225ENST00000513069 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.66□□□□□ -0.54
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SH3BP2-225ENST00000513069 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.65□□□□□ -0.54
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SH3BP2-225ENST00000513069 REC114Q7Z4M0 266 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC140Q96MF4 163 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 HINT2Q9BX68 163 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 FKBP11Q9NYL4 201 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 S4R3C0 116 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 MFSD2BA6NFX1 497 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 DHFRP00374 187 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 IGHV3-23P01764 117 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 DEFA4P12838 97 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
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SH3BP2-225ENST00000513069 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF429Q86V71 674 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 OR4A16Q8NH70 328 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 TGP01266 2768 aa11.62□□□□□ -0.55
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SH3BP2-225ENST00000513069 SYNJ2BPP57105 145 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM187Q14656 261 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 GALNT14Q96FL9 552 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM56Q96MV1 263 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 PRR13Q9NZ81 148 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP5D1E7EU14 171 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 ST8SIA3O43173 380 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-225ENST00000513069 INSL3P51460 131 aa11.6□□□□□ -0.55
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