RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 RPA2P15927 270 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 LPAR6P43657 344 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 UCP3P55916 312 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF45Q02386 682 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 ATP5G2Q06055 141 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 TATDN3Q17R31 274 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 LCN12Q6JVE5 192 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 CCDC190Q86UF4 302 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC38A6Q8IZM9 456 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 IL17DQ8TAD2 202 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 S100ZQ8WXG8 99 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC2A9Q9NRM0 540 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM140Q9NV12 185 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAV3A0A0B4J244 114 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A1B0GW64 132 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 GABARAPH6UMI1 98 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 TBPP20226 339 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 ETV6P41212 452 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 NECAP1Q8NC96 275 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM110AQ9BQ89 295 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 SOSTQ9BQB4 213 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 COMMD5Q9GZQ3 224 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP2-205ENST00000502260 MARCH11A6NNE9 402 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 OR2J3O76001 311 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 RAB3DO95716 219 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 DHFRP00374 187 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 KRASP01116 189 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 PGAM2P15259 253 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 AREGP15514 252 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 PSMB6P28072 239 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 TAS2R19P59542 299 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 OR2B8PP59922 312 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 IL18Q14116 193 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF585BQ52M93 769 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 TBC1D26Q86UD7 250 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 ARRDC1Q8N5I2 433 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 TSC22D3Q99576 134 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 PLEKHA3Q9HB20 300 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 CGB1A6NKQ9 187 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 SNAPC5O75971 98 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 CD74P04233 296 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 CRYGCP07315 174 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 FGF2P09038 288 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 G6PCP35575 357 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 RPEL1Q2QD12 228 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 C15orf32Q32M92 178 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 LHFPL1Q86WI0 220 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 V9GYH0 126 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF785A8K8V0 405 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 CTDSPLO15194 276 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 REG1AP05451 166 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 DEFA4P12838 97 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 CTRB1P17538 263 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 CD81P60033 236 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF846Q147U1 533 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 PYDC2Q56P42 97 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM209BQ5JX69 171 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 CTRB2Q6GPI1 263 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 STEAP1BQ6NZ63 245 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 FANCD2OSQ96PS1 177 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 NEURL2Q9BR09 285 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 PEMTQ9UBM1 199 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 NDUFB8O95169 186 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 CD7P09564 240 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 PI3P19957 117 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 PPP5CP53041 499 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP2-205ENST00000502260 PIGPP57054 158 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.6 ms