RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ERVK11-1P61568 191 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM177Q53S58 311 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 HOGA1Q86XE5 327 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8N976 141 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 AGMATQ9BSE5 352 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 JPT1Q9UK76 154 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GV50 99 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T8A6NH00 312 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 E7EQL1 145 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SIRPB1O00241 398 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SOCS1O15524 211 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SYNGR1O43759 233 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CD5LO43866 347 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PDE6DO43924 150 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MMP9P14780 707 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 IGFBP2P18065 325 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DUSP1P28562 367 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 THBS3P49746 956 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM50BP56557 158 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PSG9Q00887 426 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GNMTQ14749 295 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 LTC4SQ16873 150 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 UHRF2Q96PU4 802 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PECRQ9BY49 303 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 HES4Q9HCC6 221 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNA1BQ00975 2339 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PPV4 95 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 WIPF3A6NGB9 483 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 B9A039 149 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MPPED1O15442 326 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 NUPR1O60356 82 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PDCD6O75340 191 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CDS2O95674 445 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNA5P01569 189 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PRB1P04280 392 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OMGP23515 440 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 NPBWR2P48146 333 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PIGPP57054 158 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 AESQ08117 197 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 HSD52Q0P140 79 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TESK1Q15569 626 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 COX19Q49B96 90 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 AK3Q9UIJ7 227 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.01□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE10A6NGK3 116 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-46P01743 117 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 REG1AP05451 166 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GRPP07492 148 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4F17Q8NGA8 305 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8TCH9 128 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RAX2Q96IS3 184 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 HARBI1Q96MB7 349 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4F4Q96R69 305 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CITED1Q99966 193 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PSG8Q9UQ74 426 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C17orf100A8MU93 164 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R1X1 148 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFRSF1AP19438 455 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF146Q15072 292 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PMCHL1Q16048 86 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PIGYQ3MUY2 71 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF562Q6V9R5 426 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DERL1Q9BUN8 251 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB1BQ9H0U4 201 aa6□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MS4A5Q9H3V2 200 aa6□□□□□ -1.45
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