RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491843.2

ZNF638-222, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-222	ENST00000491843	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		0.39	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	RP1	P56715	2156 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	FUOM	A2VDF0	154 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	TMEM212	A6NML5	194 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	UBB	P0CG47	229 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	CAV1	Q03135	178 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	BATF	Q16520	125 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF550	Q7Z398	422 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	LAMA4	Q16363	1823 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	C21orf140	B9A014	251 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	YEATS4	O95619	227 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	C8orf88	P0DMB2	117 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	SLC51B	Q86UW2	128 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.37	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	ABCC11	Q96J66	1382 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	REG1A	P05451	166 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM228B	P0C875	321 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	MED21	Q13503	144 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	PPP1R1A	Q13522	171 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	CST9	Q5W186	159 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	IL36B	Q9NZH7	164 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	DCC	P43146	1447 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	ADGRB2	O60241	1585 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	GGT3P	A6NGU5	568 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	SSNA1	O43805	119 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	STX5	Q13190	355 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	DEFB125	Q8N687	156 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		0.34	□□□□□ -2.35
ZNF638-222	ENST00000491843	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	KCNE1	P15382	129 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	MYL12A	P19105	171 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	MAP3K7CL	P57077	242 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	CCL20	P78556	96 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	AAED1	Q7RTV5	226 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	COCH	O43405	550 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	OR5F1	O95221	314 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	PRM2	P04554	102 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	TYMS	P04818	313 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	MARCKSL1	P49006	195 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	UBE2G2	P60604	165 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	COMMD7	Q86VX2	200 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843		M0R2N4	97 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	PDE6H	Q13956	83 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	LCN15	Q6UWW0	184 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	PFN4	Q8NHR9	129 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	TMEM106A	Q96A25	262 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	C3orf18	Q9UK00	162 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	PFDN6	O15212	129 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	UCHL3	P15374	230 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	BRS3	P32247	399 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	MAP2K4	P45985	399 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	RSU1	Q15404	277 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ZNF638-222	ENST00000491843	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		0.31	□□□□□ -2.36

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