RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	DHFR	P00374	187 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGV3	P03979	118 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1C4	P17516	323 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZP3	P21754	424 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4A16	Q8NH70	328 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PRND	Q9UKY0	176 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB5B	O43169	146 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1C2	P52895	323 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TPPP2	P59282	170 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	COL7A1	Q02388	2944 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	UCP1	P25874	307 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SP6	Q3SY56	376 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5B12	Q96R08	314 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WW49	117 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SRPX	P78539	464 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CDS2	O95674	445 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	APELA	P0DMC3	54 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFA4	P12838	97 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SAP30	O75446	220 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2B8P	P59922	312 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KLK9	Q2XQG4	91 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		13.27	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LYRM1	O43325	122 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFB6	O95139	128 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	VAMP1	P23763	118 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CCR6	P51684	374 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SLURP1	P55000	103 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	LGI3	Q8N145	548 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR25	Q96S07	402 aa		13.26	□□□□□ -0.29

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