RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	FHL3	Q13643	280 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	PHB2	Q99623	299 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0B4J293	547 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0B4J2A0	478 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0G2JRQ6	117 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	PF4V1	P10720	104 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	AKR1C4	P17516	323 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	PSMB6	P28072	239 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	AKR1C2	P52895	323 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	IFITM3	Q01628	133 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	NMS	Q5H8A3	153 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM65	Q6PI78	240 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	TREML4	Q6UXN2	200 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	P2RX4	Q99571	388 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	COA4	Q9NYJ1	87 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	HMX3	A6NHT5	357 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	SFT2D2	O95562	160 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	AREG	P15514	252 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	PRCD	Q00LT1	54 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	PPP1R1A	Q13522	171 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	LGI3	Q8N145	548 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5T1	Q8NG75	326 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	USMG5	Q96IX5	58 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	GNB4	Q9HAV0	340 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	NSG2	Q9Y328	171 aa		12.85	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	MYCNOS	P40205	109 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	TPPP2	P59282	170 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	WT1-AS	Q06250	92 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC35G3	Q8N808	338 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF114	Q8NC26	417 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	OR52E5	Q8NH55	327 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4A16	Q8NH70	328 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		12.84	□□□□□ -0.35
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0G2JLM5	398 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PRX2	142 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	TRGV3	P03979	118 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	TCRB	P04435	133 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZRM9	215 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	NECAP1	Q8NC96	275 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	RAX2	Q96IS3	184 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		12.83	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	DHFR	P00374	187 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4E1	P0C645	316 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	APELA	P0DMC3	54 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC25A6	P12236	298 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	DHRS2	Q13268	280 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR146	Q96CH1	333 aa		12.82	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	C9orf170	A2RU37	121 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	NUDT19	A8MXV4	375 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	ST8SIA3	O43173	380 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	VAMP1	P23763	118 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM209B	Q5JX69	171 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	LYG2	Q86SG7	212 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	OR2C3	Q8N628	320 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	MS4A10	Q96PG2	267 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	PRR13	Q9NZ81	148 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	CCL24	O00175	119 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	PITX3	O75364	302 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HCLS1-208	ENST00000487290	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36

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