RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 DEFB125Q8N687 156 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 NRGNQ92686 78 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 PCED1BQ96HM7 432 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF681Q96N22 645 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 P2RX4Q99571 388 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 DERL1Q9BUN8 251 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 LYRM4Q9HD34 91 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TAS2R4Q9NYW5 299 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 B4GALT7Q9UBV7 327 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 MED31Q9Y3C7 131 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 COL4A5P29400 1685 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0G2JMM0 328 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PPB8 328 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 IGSF23A1L1A6 192 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFP92A6NM28 416 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 KIR3DP1A8MWS1 328 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR75O95800 540 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 RENP00797 406 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TTRP02766 147 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 CATP04040 527 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 PMCHP20382 165 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 OMGP23515 440 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP5-9P26371 169 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 SSTR5P35346 364 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 CCR2P41597 374 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 DNASE1L1P49184 302 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TBPL1P62380 186 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 Q0VG73 95 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ZP4Q12836 540 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 RUNX3Q13761 415 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 OR1Q1Q15612 314 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC21Q5SSG8 566 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 GLYATL3Q5SZD4 288 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 FHL5Q5TD97 284 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM64Q6YI46 380 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 Q6ZVQ6 151 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM86AQ8N2M4 240 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TSTD1Q8NFU3 115 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 C11orf52Q96A22 123 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 OR4F4Q96R69 305 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP5SQ99766 215 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 HINT2Q9BX68 163 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR76Q9H967 626 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR54Q9H977 334 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 NPVFQ9HCQ7 196 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 NRN1Q9NPD7 142 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 PSG8Q9UQ74 426 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0D9SEW6 157 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 PSMB11A5LHX3 300 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM231BA6NCW3 169 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-210ENST00000485459 DPRXA6NFQ7 191 aa3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms