RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 OR1L8Q8NGR8 309 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 TRIM63Q969Q1 353 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 PRRT1Q99946 306 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 C5orf66Q9H5L9 145 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A8Q9NY64 477 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 NDUFA13Q9P0J0 144 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 PRNDQ9UKY0 176 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 OR51B2Q9Y5P1 312 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-211ENST00000480301 DBX1A6NMT0 343 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC2P0DI81 140 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC2BP0DI82 140 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 C15orf32Q32M92 178 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 Q8N402 240 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TSC22D3Q99576 134 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 FBXL7Q9UJT9 491 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 C15orf61A6NNL5 157 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 NDUFB8O95169 186 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 DHFRP00374 187 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 ZP3P21754 424 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 ETV6P41212 452 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 INSL3P51460 131 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 SP6Q3SY56 376 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 ACSM6Q6P461 480 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 MRAPQ8TCY5 172 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TMEM14BQ9NUH8 114 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 DMRT1Q9Y5R6 373 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 K7EIL1 84 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1-5P01602 117 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 UCP1P25874 307 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 WT1-ASQ06250 92 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 GDPD1Q8N9F7 314 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 OR5B3Q8NH48 314 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 FKBP11Q9NYL4 201 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 B3GALNT1O75752 331 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 OR13C7P0DN81 318 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 DEFA4P12838 97 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 ZNF429Q86V71 674 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 HINT2Q9BX68 163 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 MCUBQ9NWR8 336 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 BMPR1BO00238 502 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 SAP30O75446 220 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 P0C879 139 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TOMM5Q8N4H5 51 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 OR4A16Q8NH70 328 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 SRRQ9GZT4 340 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 NAA60Q9H7X0 242 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 OR5AC1P0C628 307 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 RPEL1Q2QD12 228 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TRIM16LQ309B1 348 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 GLYATL2Q8WU03 294 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TMEM230Q96A57 120 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TMEM222Q9H0R3 208 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 S4R3C0 116 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 A0A0B4J293 547 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 ATG12O94817 140 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 CDS2O95674 445 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-23P01764 117 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 SYNJ2BPP57105 145 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 AP3S2P59780 193 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 FAM209BQ5JX69 171 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 CCDC140Q96MF4 163 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 TMEM56Q96MV1 263 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JRQ6 117 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 MFSD2BA6NFX1 497 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 PPP5D1E7EU14 171 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 FAUP35544 74 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 AKR1C2P52895 323 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 MFAP2P55001 183 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 IL34Q6ZMJ4 242 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 OR9G4Q8NGQ1 327 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 LHFPL5Q8TAF8 219 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 OR4C12Q96R67 309 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 ELOVL1Q9BW60 279 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 PRCDQ00LT1 54 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 DHODHQ02127 395 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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