RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 G6PCP35575 357 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 SLURP1P55000 103 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 C15orf32Q32M92 178 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 OR4A16Q8NH70 328 aa10.27□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.27□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.25□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 CGB1A6NKQ9 187 aa10.24□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 OR13C7P0DN81 318 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 UCP1P25874 307 aa10.24□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 TOMM5Q8N4H5 51 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 OR51S1Q8NGJ8 323 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 VN1R17PQ8TDU5 208 aa10.24□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 GPR132Q9UNW8 380 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 CDS2O95674 445 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 PI3P19957 117 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 ERHP84090 104 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 DEFB121Q5J5C9 76 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 CCDC190Q86UF4 302 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 MRGPRFQ96AM1 343 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 TP53RKQ96S44 253 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 PDCD10Q9BUL8 212 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 TMEM222Q9H0R3 208 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 MCUBQ9NWR8 336 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 K7EIL1 84 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 LGALS9O00182 355 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1-39P01597 117 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1D-39P04432 117 aa10.22□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 WT1-ASQ06250 92 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 FAM106AQ4KMX7 169 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 FAAP20Q6NZ36 180 aa10.22□□□□□ -0.77
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PRAME-211ENST00000476336 OR1P1Q8NH06 330 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 GALNT14Q96FL9 552 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 HINT2Q9BX68 163 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 C5orf66Q9H5L9 145 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 NAA60Q9H7X0 242 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 NSG2Q9Y328 171 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-211ENST00000476336 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
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