RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 RAB4AP20338 218 aa7.56□□□□□ -1.2
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DDX39B-215ENST00000462256 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.56□□□□□ -1.2
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DDX39B-215ENST00000462256 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.54□□□□□ -1.2
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DDX39B-215ENST00000462256 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM86BQ8N661 226 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 FRYLO94915 3013 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 ITPR3Q14573 2671 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 ATRQ13535 2644 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 MSGN1A6NI15 193 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 C17orf98A8MV24 154 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-215ENST00000462256 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.53□□□□□ -1.2
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