RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GVX0 72 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GX30 115 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TTC26A0AVF1 554 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TSPY2A6NKD2 308 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 D6RAR5 112 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 K7EQM0 130 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TSPAN4O14817 238 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SULT1B1O43704 296 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 GMDSO60547 372 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 PTP4A3O75365 173 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 STX11O75558 287 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR2F2O95006 317 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 HPRT1P00492 218 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR9G9P0C7N8 305 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 LIMS3P0CW19 117 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 LIMS4P0CW20 117 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 NCAM1P13591 858 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 ICAM2P13598 275 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 CD24P25063 80 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SULT1A1P50225 295 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SULT1A2P50226 295 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 UBE2G2P60604 165 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SNAP25P60880 206 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 PAFAH1B2P68402 229 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 MED21Q13503 144 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SLC36A2Q495M3 483 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM155Q4W5P6 130 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 NHLRC3Q5JS37 347 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 C1orf194Q5T5A4 169 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 FAXCQ5TGI0 409 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 GGNBP1Q5YKI7 109 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 ARMC6Q6NXE6 501 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 NPSR1Q6W5P4 371 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM86AQ8N2M4 240 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 KCNRGQ8N5I3 272 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 PDILTQ8N807 584 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SLC25A29Q8N8R3 303 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 MLKLQ8NB16 471 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 MFSD9Q8NBP5 474 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR1J2Q8NGS2 313 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR13C3Q8NGS6 347 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR6S1Q8NH40 331 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR51A7Q8NH64 312 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR56B4Q8NH76 319 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 STOML3Q8TAV4 291 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 ORAOV1Q8WV07 137 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 NT5C3BQ969T7 300 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TEKT1Q969V4 418 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 EXOC4Q96A65 974 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 C16orf92Q96LL3 132 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TSSK3Q96PN8 268 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 ROGDIQ9GZN7 287 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 RAB1BQ9H0U4 201 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 NMRAL1Q9HBL8 299 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 KCNIP2Q9NS61 270 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR6C3Q9NZP0 311 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR6C2Q9NZP2 312 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SLC24A2Q9UI40 661 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 BAIAP2Q9UQB8 552 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa-2.75□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TRAV6A0A075B6T7 132 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 A0A087X0M5 115 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD62A6NC57 917 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 MCRIP1C9JLW8 97 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 C17orf112F2Z3M2 114 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 H3BT86 120 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SLC1A7O00341 560 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 ACKR2O00590 384 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 WBP4O75554 376 aaKnown RBP-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SERPINI2O75830 405 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR2A4O95047 310 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 ASMTLO95671 621 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 RAB3DO95716 219 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 TTC4O95801 387 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 OR4E1P0C645 316 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 SEC11BP0C7V7 166 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 CD8BP10966 210 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 IRF2P14316 349 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 RAC2P15153 192 aa-2.76□□□□□ -2.85
SNORD54-201ENST00000459159 HLA-GP17693 338 aa-2.76□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms