RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CA6P23280 308 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CX3CL1P78423 397 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ZIC4Q8N9L1 334 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SDF2Q99470 211 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 FOXC2Q99958 501 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 OSTCQ9NRP0 149 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TAAR2Q9P1P5 351 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 DOCK8Q8NF50 2099 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2L6O14933 153 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 NTF4P34130 210 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 RRN3P1Q2M238 152 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf44Q96CB5 159 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 RASL10BQ96S79 203 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 JPT2Q9H910 190 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 DOCK11Q5JSL3 2073 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 IGLL5B9A064 214 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 M0R2P5 195 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 HBDP02042 147 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV4-34P06331 123 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CD7P09564 240 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.664e-10■■■□□ 14.7
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 IGKCP01834 107 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 XGP55808 180 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TBR1Q16650 682 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 DRAM1Q8N682 238 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 OCC1Q8TAD7 63 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 METRNQ9UJH8 293 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GTH9 108 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GX51 115 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf51A8MQB3 221 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 NUPR1O60356 82 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 STATHP02808 62 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 OR10AC1Q8NH08 325 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 GATAD1Q8WUU5 269 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PRORYQ9H606 182 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 THBDP07204 575 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN17P56750 224 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 MDP1Q86V88 176 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 MORN4Q8NDC4 146 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SPTBP11277 2137 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQH9 124 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ACYP1P07311 99 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PMAIP1Q13794 54 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF146Q15072 292 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00305Q7Z4B0 112 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 OR52N5Q8NH56 324 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00479Q96M42 142 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 VSIRQ9H7M9 311 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LINC01549A6NIU2 74 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PIN1P1O15428 100 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf74Q32Q52 190 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 FGFRL1Q8N441 504 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PROCRQ9UNN8 238 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SLIT2O94813 1529 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 USP54Q70EL1 1684 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 CXCL5P42830 114 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 OTOSQ8NHW6 89 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 BMFQ96LC9 184 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PDFQ9HBH1 243 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SLC48A1Q6P1K1 146 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 C10orf105Q8TEF2 133 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 H0YJW9 148 aa4.69□□□□□ -1.66
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