RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DEFA4P12838 97 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UCP1P25874 307 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DHODHQ02127 395 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC190Q86UF4 302 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC22AQ96IW7 307 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PEMTQ9UBM1 199 aa6.61□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGHV3-11P01762 117 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKR1C2P52895 323 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP5CP53041 499 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRPXP78539 464 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPEL1Q2QD12 228 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C15orf32Q32M92 178 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LCE2CQ5TA81 110 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACSM6Q6P461 480 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q8N402 240 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF114Q8NC26 417 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4A16Q8NH70 328 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRAPQ8TCY5 172 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCUN1D4Q92564 292 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL22RA2Q969J5 263 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GALNT14Q96FL9 552 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUX3Q96PT4 197 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR5B12Q96R08 314 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4C12Q96R67 309 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 V9GYH0 126 aa6.6□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HMX3A6NHT5 357 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SAP30O75446 220 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANXA3P12429 323 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 G6PCP35575 357 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRCDQ00LT1 54 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF45Q02386 682 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM16LQ309B1 348 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PYDC2Q56P42 97 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR1P1Q8NH06 330 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM63Q969Q1 353 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAA60Q9H7X0 242 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR132Q9UNW8 380 aa6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1B0GW64 132 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CGB1A6NKQ9 187 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 E7EUB6 86 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LGALS9O00182 355 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CORTO00230 105 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2J3O76001 311 aa6.58□□□□□ -1.36
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDS2O95674 445 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms