RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 C7orf71A4D174 169 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 J3QW42 95 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SLC17A3O00476 420 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPB7O75200 414 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CNTFRP26992 372 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HCP5Q6MZN7 132 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP161Q6P656 301 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 KCNS1Q96KK3 526 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SNAI2O43623 268 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 Q6AWC8 147 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CCL13Q99616 98 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 RNF126Q9BV68 326 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JLM5 398 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 H0YIZ8 118 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A17O43808 307 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 VENTXO95231 258 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ASIPP42127 132 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CCL8P80075 99 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ODAMA1E959 279 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 RRHO14718 337 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-48P01763 117 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 COX5BP10606 129 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HBBP68871 147 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF124Q15973 351 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 FGF11Q92914 225 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 MARCH11A6NNE9 402 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 VWA8A3KMH1 1905 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PTGDSP41222 190 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CALYQ9NYX4 217 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GWB2 263 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGHMP01871 453 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PDLIM4P50479 330 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LRTM2Q8N967 370 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BKO60814 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BJP06899 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BOP23527 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BBP33778 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BDP58876 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BCP62807 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CENPWQ5EE01 88 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PMS2CLQ68D20 193 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TUBA4BQ9H853 241 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CADP27708 2225 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GTI1 187 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LCN2P80188 198 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF146Q15072 292 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01549A6NIU2 74 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV3-19P01714 112 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CTSSP25774 331 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 GAS1P54826 345 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 MGAMO43451 1857 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms