RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 EXPH5Q8NEV8 1989 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 REM1O75628 298 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TACSTD2P09758 323 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 FABP2P12104 132 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK2P24941 298 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GGTLC2Q14390 218 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OR8S1Q8NH09 359 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNA1CQ13936 2221 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MS4A18H0YCH9 400 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFA7O95182 113 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN17P56750 224 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 Q0VG73 95 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM99Q8N816 258 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4K13Q8NH42 304 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GNG12Q9UBI6 72 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PP11 408 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYBB3P26998 211 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0A6YYD5 115 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PRF3 423 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PRM7 423 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BMG7 143 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CD3DP04234 171 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM53BQ14153 422 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 Q56UQ5 140 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DHDHQ9UQ10 334 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OBSL1O75147 1896 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 hDV102S1A0JD36 115 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 F8W1H4 67 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 J3QRE1 110 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 M0QZQ0 153 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 APOMO95445 188 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 BAGE3Q86Y29 109 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 BAGE2Q86Y30 109 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OR8B3Q8NGG8 313 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DOK4Q8TEW6 326 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 LMX1BO60663 402 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 NGFP01138 241 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MT-ND6P03923 174 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 COX7A2P14406 83 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 IL3RAP26951 378 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 WASP42768 502 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 NOXRED1Q6NXP6 359 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OR13H1Q8NG92 308 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 NEURL3Q96EH8 262 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 AQP10Q96PS8 301 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 EHFQ9NZC4 300 aa5.62□□□□□ -1.51
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RABGEF1-202ENST00000380828 DOCK9Q9BZ29 2069 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 A6NDN8 102 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR137BO60478 399 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 CA2P00918 260 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 H2BFMP0C1H6 154 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC11BP0C7V7 166 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR183P32249 361 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2G5P39877 138 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2T10Q8NGZ9 312 aa5.61□□□□□ -1.51
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RABGEF1-202ENST00000380828 DOCK4Q8N1I0 1966 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PLXNA2O75051 1894 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 MTCP1P56278 107 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB103AP81534 67 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.61□□□□□ -1.51
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