RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF738Q8NE65 137 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 YPEL2Q96QA6 119 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PSENENQ9NZ42 101 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 KLK11Q9UBX7 282 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HELTA6NFD8 242 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MMP23AO75900 390 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.841e-6■■■■□ 22.6
PTPRC-201ENST00000348564 MYCNOSP40205 109 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF79Q15937 498 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM42Q69YG0 159 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 WDR86Q86TI4 376 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NACAE9PAV3 2078 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SSSCA1O60232 199 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RAB14P61106 215 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 DHRS2Q13268 280 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 UNC119Q13432 240 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP69Q49AA0 526 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CORTO00230 105 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FGF16O43320 207 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LYRM1O43325 122 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PSG5Q15238 335 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 FAM209BQ5JX69 171 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF529Q6P280 563 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SSX7Q7RTT5 188 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 BLNKQ8WV28 456 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 COQ2Q96H96 371 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PRELID1Q9Y255 219 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM14DPA8MWL7 114 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf112F2Z3M2 114 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DQB1P01920 261 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR10J4P0C629 311 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RAB9AP51151 201 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CST9LP1Q5W188 147 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PTX4Q96A99 478 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 USMG5Q96IX5 58 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC31A2O15432 143 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IL4P05112 153 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF688P0C7X2 276 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CT45A10P0DMU9 189 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CD37P11049 281 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 DLX6P56179 175 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 BTNL8Q6UX41 500 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NECAP1Q8NC96 275 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IL17DQ8TAD2 202 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GU03 582 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MARCH11A6NNE9 402 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RAMP3O60896 148 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 IFITM3Q01628 133 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR5I1Q13606 314 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OXA1LQ15070 435 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR4X1Q8NH49 305 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01587Q99440 93 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SIRPDQ9H106 197 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 MPTX1A8MV57 137 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 S1PR2O95136 353 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 OR5AC1P0C628 307 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 SLURP1P55000 103 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.56□□□□□ -1.84
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