RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 AVPI1Q5T686 147 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 A0A1W2PN81 502 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 FBP1P09467 338 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 CHRNA7P36544 502 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 BSXQ3C1V8 233 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 TEPPQ6URK8 271 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 DTX2Q86UW9 622 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.99□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 COLCA2A8K830 154 aa14.98□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.98□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.98□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.98□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.98□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.98□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 A0A087WWC5 75 aa14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 IGLV1-47P01700 117 aa14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 SOD3P08294 240 aa14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 AKR1C3P42330 323 aa14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 LGALS7P47929 136 aa14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 KALRNO60229 2985 aa14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 A0A1W2PPR1 153 aa14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 A0A1W2PPV4 95 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 B4DEV8 164 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 IGLV2-23P01705 113 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 LIPFP07098 398 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 FOLR2P14207 255 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 MLXQ9UH92 298 aa14.96□□□□□ -0.01
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM250H0YL14 139 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 C19orf84I3L1E1 186 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 YIF1AO95070 293 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 MT-ND4LP03901 98 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 IGFBP2P18065 325 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 OPN1MWP04001 364 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 MIC13Q5XKP0 118 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 C1orf159Q96HA4 380 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 CHODLQ9H9P2 273 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.95□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 B2MP61769 119 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 RNF212Q495C1 297 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.94□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 CD81P60033 236 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 TEX45Q8NA69 505 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 NBASA2RRP1 2371 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 OR2C1O95371 312 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 31.9
HCLS1-201ENST00000314583 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 STPG3Q8N7X2 389 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 CRYBA1P05813 215 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 STAG3L2P0CL84 134 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 STAG3L3P0CL85 134 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 MAS1LP35410 378 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 CD69Q07108 199 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 CXorf65A6NEN9 183 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF727A8MUV8 499 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 M0R1W7 72 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 SLC25A17O43808 307 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 LY6HO94772 140 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 CXorf1O96002 111 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 RHOBP62745 196 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 PRR20EP86478 221 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 PRR20CP86479 221 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 PRR20DP86480 221 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-201ENST00000314583 PRR20BP86481 221 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms