RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 F2RL2O00254 374 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 HOXC12P31275 282 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 PRR20EP86478 221 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 PRR20CP86479 221 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 PRR20DP86480 221 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 PRR20BP86481 221 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 PRR20AP86496 221 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 GUSBP1Q15486 140 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 TMEM183BQ1AE95 376 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 MIR17HGQ75NE6 70 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 FAM216AQ8WUB2 273 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 RNF114Q9Y508 228 aa12.28□□□□□ -0.44
SYP-201ENST00000263233 CA2P00918 260 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 KIR2DS2P43631 304 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 OR4S2Q8NH73 311 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GNB1LQ9BYB4 327 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SAMD10Q9BYL1 202 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 PRR14LQ5THK1 2151 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 AKAP13Q12802 2813 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 A6NNC1 897 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 AHRRA9YTQ3 701 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SRRM5B3KS81 715 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 MGST3O14880 152 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 ACTL6BO94805 426 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 LINC00869P0C866 280 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 ZNF883P0CG24 379 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TNFSF10P50591 281 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 RAB31Q13636 194 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CENPWQ5EE01 88 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 OR4A47Q6IF82 309 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 VWA1Q6PCB0 445 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 LEAP2Q969E1 77 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TMEM14BQ9NUH8 114 aa12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GWJ7 208 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 MYOD1P15172 320 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TMEM178AQ8NBL3 297 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 ZNRF1Q8ND25 227 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 OR2Z1Q8NG97 314 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 NEUROG1Q92886 237 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 VAMP8Q9BV40 100 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SFXN3Q9BWM7 321 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GNB4Q9HAV0 340 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 FBXL7Q9UJT9 491 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CRYBB3P26998 211 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GNG4P50150 75 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 PSG5Q15238 335 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TUBG2Q9NRH3 451 aa12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 HELTA6NFD8 242 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SPINK4O60575 86 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CYB5R2Q6BCY4 276 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 PQLC2Q6ZP29 291 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 DOLPP1Q86YN1 238 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CALYQ9NYX4 217 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 DLEU1O43261 78 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GPX1P07203 203 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 OR10J4P0C629 311 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CX3CL1P78423 397 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 GCSAMQ8N6F7 178 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 Q8N976 141 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 PPP1R35Q8TAP8 253 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 FAM122AQ96E09 287 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 ENY2Q9NPA8 101 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa12.25□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 LNP1A1A4G5 178 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 IGLV1-44P01699 117 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 BRS3P32247 399 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SPRNQ5BIV9 151 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 ZNF503Q96F45 646 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 NABP2Q9BQ15 211 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 IL19Q9UHD0 177 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 NAT8BQ9UHF3 227 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 SLC45A2Q9UMX9 530 aa12.24□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CGB3P0DN86 165 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 CGB7P0DN87 165 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 MSMPQ1L6U9 139 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 C17orf58Q2M2W7 97 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.23□□□□□ -0.45
SYP-201ENST00000263233 C9orf106Q8NAJ2 232 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms