RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 TMEM140Q9NV12 185 aa12.94□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 CACNA1HO95180 2353 aa12.94□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 USF3Q68DE3 2245 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 KLK10O43240 276 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 MPDU1O75352 247 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TOMM40O96008 361 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 NBEAP1P0C6P0 100 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 Q8N7P7 452 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 OR4F5Q8NH21 305 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 GATAD1Q8WUU5 269 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 LEAP2Q969E1 77 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 OR4F4Q96R69 305 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 PPP5D1E7EU14 171 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 CD40P25942 277 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 RPL19P84098 196 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 ADIRFQ15847 76 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 STUMQ69YW2 141 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 PPIAL4AQ9Y536 164 aa12.93□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.92□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 RRHO14718 337 aa12.92□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 GFRA3O60609 400 aa12.92□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 PAGE4O60829 102 aa12.92□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 THBS3P49746 956 aa12.92□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 Q5PR19 223 aa12.92□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.92□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 BMP5P22003 454 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TMPRSS3P57727 454 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 BSXQ3C1V8 233 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 UTF1Q5T230 341 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 C22orf34Q6ZV56 151 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 ABHD12Q8N2K0 398 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 STPG4Q8N801 248 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TBX15Q96SF7 602 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 PARLQ9H300 379 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TCF19Q9Y242 345 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 A0A1W2PPV4 95 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TM4SF5O14894 197 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 OPRK1P41145 380 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 RPL23P62829 140 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TMEM249Q2WGJ8 235 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 RAB1CQ92928 201 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 GAFA1Q96PS6 74 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 CCL13Q99616 98 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa12.91□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TCF15Q12870 199 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 TREML4Q6UXN2 200 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 ZNF788Q6ZQV5 615 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 NUP37Q8NFH4 326 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 LOC400499M0QZD8 3231 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 C15orf61A6NNL5 157 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 PRSS46E5RG02 174 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 ACY3Q96HD9 319 aa12.9□□□□□ -0.34
POP4-201ENST00000221770 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 GYPAP02724 150 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 TDRG1Q3Y452 100 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 ZNF439Q8NDP4 499 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 MS4A5Q9H3V2 200 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 LINC00574Q9H8X3 128 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 C11orf94C9JXX5 98 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 OR5G3P0C626 314 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 DEFA4P12838 97 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 TMEM30BQ3MIR4 351 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 GCSAMLQ5JQS6 135 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 OR4A47Q6IF82 309 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 TMEM108Q6UXF1 575 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 S100A7AQ86SG5 101 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 OR2D3Q8NGH3 330 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 NPVFQ9HCQ7 196 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 HRASP01112 189 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 MMDQ15546 238 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 OCIAD2Q56VL3 154 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 TEX36Q5VZQ5 186 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 TCF23Q7RTU1 214 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 TMEM170AQ8WVE7 144 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 MGST2Q99735 147 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 ENY2Q9NPA8 101 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 DOCK11Q5JSL3 2073 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa12.88□□□□□ -0.35
POP4-201ENST00000221770 F6UZH7 168 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms