RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.9□□□□□ -0.98
TRPS1-201ENST00000220888 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 CCL3L1P16619 93 aa8.9□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 ZP1P60852 638 aa8.9□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00862A6NCI5 91 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 ATP5LO75964 103 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 CXCL3P19876 107 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF585BQ52M93 769 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.89□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 P2RY4P51582 365 aa8.89□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.89□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 CDK2AP2O75956 126 aa8.89□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.89□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A16P16260 332 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 FUT5Q11128 374 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 MUC21Q5SSG8 566 aa8.88□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.88□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 PRR32B1ATL7 298 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 UMODP07911 640 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 JKAMPQ9P055 326 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 STRCQ7RTU9 1775 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 CD24P25063 80 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM160Q9NX00 188 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 C4orf51C9J302 202 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 H0YL77 283 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 CELA3BP08861 270 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 UCP3P55916 312 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 PMCHL1Q16048 86 aa8.88□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 RAMP1O60894 148 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 IL18BPO95998 194 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 IRF3Q14653 427 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 KLK2P20151 261 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 HBBP68871 147 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 SPTBN2O15020 2390 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 PEX7O00628 323 aa8.87□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 SRIP30626 198 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 PARLQ9H300 379 aa8.87□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 A0A087X0M5 115 aa8.86□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GX30 115 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 TIMP3P35625 211 aa8.86□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 COTL1Q14019 142 aa8.86□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
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TRPS1-201ENST00000220888 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 GZMMP51124 257 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 PSMG4Q5JS54 123 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 GGACTQ9BVM4 153 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 CEP250Q9BV73 2442 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-201ENST00000220888 TIMM23O14925 209 aa8.86□□□□□ -0.99
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