RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637121.1

EFHC1-228, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 3

Gene EFHC1, Length 2,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-228	ENST00000637121	FOXF2	Q12947	444 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	GAMT	Q14353	236 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FAM186A	A6NE01	2351 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	HELT	A6NFD8	242 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121		K7EP13	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	PHOX2A	O14813	284 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	CEACAM4	O75871	244 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	YIF1A	O95070	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	SSTR5	P35346	364 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	CDKN1A	P38936	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	PDLIM4	P50479	330 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121		Q6ZR03	302 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FRZB	Q92765	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	LINC00473	A8K010	186 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	WNT9B	O14905	357 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FCGR3B	O75015	233 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	TNFSF13	O75888	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	CGA	P01215	116 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	GCG	P01275	180 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	GYPA	P02724	150 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	CCKAR	P32238	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FABP6	P51161	128 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	CCL11	P51671	97 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	PKIA	P61925	76 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	RHOB	P62745	196 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FOXL1	Q12952	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121		M0R1X1	148 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	WIPF1	O43516	503 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	PAGE4	O60829	102 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	LHB	P01229	141 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	TIMP3	P35625	211 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	COX19	Q49B96	90 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121		Q8TCH9	128 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EFHC1-228	ENST00000637121	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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