RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	PRND	Q9UKY0	176 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392		A0A0U1RQK1	487 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	ST8SIA3	O43173	380 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	KBTBD11	O94819	623 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	OR2F2	O95006	317 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	LYL1	P12980	280 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	OR2F1	Q13607	317 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF345	Q14585	488 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	PSG5	Q15238	335 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	TMUB2	Q71RG4	321 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	C1RL	Q9NZP8	487 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CELF4-222	ENST00000601392	MED6	O75586	246 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	IFNA7	P01567	189 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	IGKV1D-33	P01593	117 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	IGKV1-33	P01594	117 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	CXCL2	P19875	107 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	MAS1L	P35410	378 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	OR5B3	Q8NH48	314 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	OR4A16	Q8NH70	328 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	OR1S1	Q8NH92	325 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	PIFO	Q8TCI5	191 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	C15orf61	A6NNL5	157 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	RRH	O14718	337 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	NBR2	O15453	112 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	TAS2R30	P59541	319 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SPCS3	P61009	180 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	RAB32	Q13637	225 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	MMD2	Q8IY49	270 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	RITA1	Q96K30	269 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	DEDD	O75618	318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM11	P17152	192 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	TNFRSF9	Q07011	255 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	HES1	Q14469	280 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	TEX261	Q6UWH6	196 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	OR5R1	Q8NH85	324 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	DCUN1D4	Q92564	292 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	RAB40C	Q96S21	281 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SSX3	Q99909	188 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	KIAA1456	Q9P272	454 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392		U3KQ87	197 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392		E5RGE8	158 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392		K7EPK0	472 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	FGF16	O43320	207 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SYNGR2	O43760	224 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SLC25A17	O43808	307 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	F2RL1	P55085	397 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	S100A10	P60903	97 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	MMD	Q15546	238 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	PRSS8	Q16651	343 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392		Q6YL49	198 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	SLC51B	Q86UW2	128 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CELF4-222	ENST00000601392	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78

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