RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585299.1

NFE2L1-223, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 4

Gene NFE2L1, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-223	ENST00000585299		M0QYG6	137 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	TRBV12-3	P01733	135 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	CRYGC	P07315	174 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	FGF2	P09038	288 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	AREG	P15514	252 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	S100G	P29377	79 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	LPAR6	P43657	344 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR2B8P	P59922	312 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF585B	Q52M93	769 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	LAX1	Q8IWV1	398 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR4C12	Q96R67	309 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	CD3D	P04234	171 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	IFNA6	P05013	189 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	RPA2	P15927	270 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	TBP	P20226	339 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	PSMB6	P28072	239 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	ERVK-16	P61578	105 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	CADM3	Q8N126	398 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	MARCH11	A6NNE9	402 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	GABARAP	H6UMI1	98 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR2J3	O76001	311 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	DHFR	P00374	187 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	CTRB1	P17538	263 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	KLK9	Q2XQG4	91 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	C15orf32	Q32M92	178 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299		H3BMQ9	156 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	LY86	O95711	162 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	KRAS	P01116	189 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	SYNJ2BP	P57105	145 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	RPEL1	Q2QD12	228 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	FAM209B	Q5JX69	171 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	ISOC1	Q96CN7	298 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	B9D2	Q9BPU9	175 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	BMPR1B	O00238	502 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	CD74	P04233	296 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	REG1A	P05451	166 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	SPN	P16150	400 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	G6PC	P35575	357 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	TAS2R19	P59542	299 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	TATDN3	Q17R31	274 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	SNAPC5	O75971	98 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	NDUFB8	O95169	186 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	RAB3D	O95716	219 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	DEFA4	P12838	97 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	PGAM2	P15259	253 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	RND3	P61587	244 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	CD69	Q07108	199 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NFE2L1-223	ENST00000585299	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	CTDSPL	O15194	276 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	IGLV1-51	P01701	117 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	IL18	Q14116	193 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	TERB2	Q8NHR7	220 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NFE2L1-223	ENST00000585299	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36

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