RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	DEFA6	Q01524	100 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	POU2AF1	Q16633	256 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SPRN	Q5BIV9	151 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	VHLL	Q6RSH7	139 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OR5T1	Q8NG75	326 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TNFSF4	P23510	183 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	PKIA	P61925	76 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TSTD3	H0UI37	97 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TM4SF5	O14894	197 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	AMBP	P02760	352 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	RD3L	P0DJH9	198 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TIMP3	P35625	211 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	NUBP1	P53384	320 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	STUM	Q69YW2	141 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	GCM1	Q9NP62	436 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	PRND	Q9UKY0	176 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	FUT9	Q9Y231	359 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	GAMT	Q14353	236 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	FAM78B	Q5VT40	261 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	LYG1	Q8N1E2	194 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	LEAP2	Q969E1	77 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SFRP2	Q96HF1	295 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	DERL1	Q9BUN8	251 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	GCHFR	P30047	84 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	EFNB3	Q15768	340 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	STPG3	Q8N7X2	389 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	DSCAM	O60469	2012 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SELL	P14151	372 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	BMP5	P22003	454 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	IL3RA	P26951	378 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf159	Q96HA4	380 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CA2	P00918	260 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	GCG	P01275	180 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RTL8B	Q17RB0	113 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	FAM201A	Q5SY85	155 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM18	Q96B42	140 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	GAFA1	Q96PS6	74 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0U1RQK1	487 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF320	A2RRD8	509 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-46	P01743	117 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	IRF2	P14316	349 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZS92	163 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	NEUROG1	Q92886	237 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	UHRF2	Q96PU4	802 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C1QTNF9	P0C862	333 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TTC28	Q96AY4	2481 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559		J3QR06	171 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CCKAR	P32238	428 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PRR20E	P86478	221 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PRR20C	P86479	221 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PRR20D	P86480	221 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PRR20B	P86481	221 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PRR20A	P86496	221 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PRCD	Q00LT1	54 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	UTF1	Q5T230	341 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf52	Q96A22	123 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		15.1	■□□□□ 0.01

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