RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGLV2-14P01704 120 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 NAT1P18440 290 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 S100GP29377 79 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 RCVRNP35243 200 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 RFX2P48378 723 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 TSPAN5P62079 268 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 GUCA2BQ16661 112 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPX8Q8TED1 209 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANAPC10Q9UM13 185 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ALMS1Q8TCU4 4167 aa13.04□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 BMPR1BO00238 502 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 MPPED1O15442 326 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 TNFSF12O43508 249 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 LY6G6CO95867 125 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR9G9P0C7N8 305 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 HLA-DMAP28067 261 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 RHOGP84095 191 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 TNXAQ16473 311 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRSS8Q16651 343 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM17Q86X19 198 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 MMD2Q8IY49 270 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 CD300LFQ8TDQ1 290 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 AKIP1Q9NQ31 210 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 EXTL2Q9UBQ6 330 aa13.03□□□□□ -0.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM223BA6NKX1 122 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 HRH1P35367 487 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATP5G2Q06055 141 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPAG16Q8N0X2 631 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR2A7Q96R45 310 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPIN2AQ99865 258 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa13.02□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRH1P02810 166 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPCS2Q15005 226 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 AADACL3Q5VUY0 350 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 IDO2Q6ZQW0 420 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 LYSMD2Q8IV50 215 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 FCAMRQ8WWV6 532 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 MOB3AQ96BX8 217 aa13.01□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAS1LP35410 378 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 RABL2BQ9UNT1 228 aa13□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 C2orf70A6NJV1 201 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 HPRT1P00492 218 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 FOLR2P14207 255 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 GNRHRP30968 328 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF45Q02386 682 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC25A42Q86VD7 318 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR51H1Q8NH63 302 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR4A5Q8NH83 315 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPHA2Q96T91 129 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 CXorf65A6NEN9 183 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPP5D1E7EU14 171 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPR31O00270 319 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 KBTBD11O94819 623 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 NQO2P16083 231 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 TBPP20226 339 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 EDN2P20800 178 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAS2R31P59538 309 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERVK-16P61578 105 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 PMS2P11Q13670 270 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 NECAP1Q8NC96 275 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLEKHA2Q9HB19 425 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 HRASLSQ9HDD0 168 aa12.98□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 DPPA5A6NC42 116 aa12.97□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC160A6NGH7 325 aa12.97□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTDSP2O14595 271 aa12.97□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 C15orf32Q32M92 178 aa12.97□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM209BQ5JX69 171 aa12.97□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 SSX9Q7RTT3 188 aa12.97□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 DMBX1Q8NFW5 382 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms