RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SYT8Q8NBV8 401 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 OTOFQ9HC10 1997 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF785A8K8V0 405 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 H3BSH0 61 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 LIMS3P0CW19 117 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 LIMS4P0CW20 117 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 COX5AP20674 150 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NMUP48645 174 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FMODQ06828 376 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 COX20Q5RI15 118 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ATOH7Q8N100 152 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 KCNK15Q9H427 330 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PEMTQ9UBM1 199 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FAM231BA6NCW3 169 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 RRHO14718 337 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CRYBB3P26998 211 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TIMP3P35625 211 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 LGALS7P47929 136 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 H0YL77 283 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PLPP3O14495 311 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 LEPROTL1O95214 131 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ORM2P19652 201 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MPV17L2Q567V2 206 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NRN1Q9NPD7 142 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SMPXQ9UHP9 88 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPV9 198 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM10L1P0DMW3 83 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 BCL2P10415 239 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF32P17041 273 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 RELBQ01201 579 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 OSR2Q8N2R0 312 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM19Q96E16 107 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM10Q96HG1 83 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 GPR84Q9NQS5 396 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TAL2Q16559 108 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 KLK11Q9UBX7 282 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 GASTP01350 101 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 CD8AP01732 235 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G2CQ5R387 149 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf73Q69YU5 71 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FAM166AQ6J272 317 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 DTX2Q86UW9 622 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PFN4Q8NHR9 129 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FAM168AQ92567 244 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H4GQ99525 98 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PIEZO1Q92508 2521 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0J9YW62 118 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 GYPBP06028 91 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 GPX1P07203 203 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 WNT2P09544 360 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ZG16BQ96DA0 208 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 COL4A6Q14031 1691 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 HYPMO75409 117 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 KLRD1Q13241 179 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 MUC21Q5SSG8 566 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SGMS2Q8NHU3 365 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 J3KTA2 159 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 PLAUP00749 431 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A16P16260 332 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRB-210ENST00000551525 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
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