RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540904.1

SNHG1-215, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNHG1, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-215ENST00000540904 G6PCP35575 357 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 PIGPP57054 158 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 RUNX1Q01196 453 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 DEFA5Q01523 94 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF616Q08AN1 781 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 POU2AF1Q16633 256 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 PYDC2Q56P42 97 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 LCE2CQ5TA81 110 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 DPF1Q92782 380 aa7.15□□□□□ -1.26
SNHG1-215ENST00000540904 A0A0G2JLM5 398 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 A0A1B0GW64 132 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 DPPA5A6NC42 116 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 DISC1C4P0D8 188 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 SERPINE2P07093 398 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 OR8U8P0C7N1 319 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 RND3P61587 244 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 FHL3Q13643 280 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 MCUBQ9NWR8 336 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 COPZ2Q9P299 210 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 NSG2Q9Y328 171 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 V9GYH0 126 aa7.14□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 A0A087WW49 117 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 CGB1A6NKQ9 187 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 LINC01619G3V211 115 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 H0Y980 276 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 SNAPC5O75971 98 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 BRI3O95415 125 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 REG1AP05451 166 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 AREGP15514 252 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 ECI1P42126 302 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 SLURP1P55000 103 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 OR2B8PP59922 312 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 RHOGP84095 191 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF79Q15937 498 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 CCDC190Q86UF4 302 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 Q8N402 240 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 USMG5Q96IX5 58 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 TP53RKQ96S44 253 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 PRRT1Q99946 306 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.13□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 FAM223BA6NKX1 122 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 OR2J3O76001 311 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 IGKV1-39P01597 117 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 IGKV1D-39P04432 117 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 DEFA4P12838 97 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.271e-323■■□□□ 13.1
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SNHG1-215ENST00000540904 AP3S2P59780 193 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 ZNF45Q02386 682 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 TRIM16LQ309B1 348 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 SP6Q3SY56 376 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 DCUN1D4Q92564 292 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 TRIM63Q969Q1 353 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 HINT2Q9BX68 163 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-215ENST00000540904 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.11□□□□□ -1.27
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