RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 COA4Q9NYJ1 87 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 COPZ2Q9P299 210 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX22C9J3V5 150 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 E7EUB6 86 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 H0Y980 276 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 KRASP01116 189 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 G6PCP35575 357 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 FHL3Q13643 280 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 OR5B12Q96R08 314 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SRRQ9GZT4 340 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1B0GW64 132 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 HMX3A6NHT5 357 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 G3V4G9 280 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MYOD1P15172 320 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 AP3S2P59780 193 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 C1QL4Q86Z23 238 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 OR11H1Q8NG94 326 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 MCUBQ9NWR8 336 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR132Q9UNW8 380 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 NOTCH1P46531 2555 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 CGB1A6NKQ9 187 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 IGKV1-39P01597 117 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 IGKV1D-39P04432 117 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SEC22AQ96IW7 307 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TP53RKQ96S44 253 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0G2JLM5 398 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV3-11P01762 117 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SERPINE2P07093 398 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 IGLL1P15814 213 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 OR2B8PP59922 312 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF616Q08AN1 781 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 A6NHS1 94 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 B3GALNT1O75752 331 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 SNAPC5O75971 98 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 OR8U8P0C7N1 319 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB25P57735 213 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 TSC22D3Q99576 134 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-208ENST00000531226 PRH1P02810 166 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 AREGP15514 252 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 UCP1P25874 307 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMB6P28072 239 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFA5Q01523 94 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF45Q02386 682 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 USMG5Q96IX5 58 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 PRNDQ9UKY0 176 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 NSG2Q9Y328 171 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A087WW49 117 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 C15orf61A6NNL5 157 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 CRYGCP07315 174 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 CTRB1P17538 263 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 BAK1Q16611 211 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 SP6Q3SY56 376 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 DPF1Q92782 380 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 NAA60Q9H7X0 242 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM223BA6NKX1 122 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 LINC01619G3V211 115 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 OR5AC1P0C628 307 aa14.68□□□□□ -0.06
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