RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 PSMB11A5LHX3 300 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 COQ8AQ8NI60 647 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 C15orf61A6NNL5 157 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 IGKV1-5P01602 117 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 P0C879 139 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 SLC35G3Q8N808 338 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 OR5B3Q8NH48 314 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 OR4A16Q8NH70 328 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 HAX1O00165 279 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 PRAF2O60831 178 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF429Q86V71 674 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 PHB2Q99623 299 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 LINC01548A6NM66 108 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 OR9G9P0C7N8 305 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ECSCRQ19T08 205 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 C3orf56Q8N813 242 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MDFIQ99750 246 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 CFHR3Q02985 330 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 TEX38Q6PEX7 206 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF747Q9BV97 191 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 COA4Q9NYJ1 87 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-218ENST00000525459 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 IL5P05113 134 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 LFNGQ8NES3 379 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 MITD1Q8WV92 249 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 H3BUA1 57 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 DHFRP00374 187 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 IGHG4P01861 327 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ELANEP08246 267 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 OR2B8PP59922 312 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 RGS21Q2M5E4 152 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 NMSQ5H8A3 153 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 MSGN1A6NI15 193 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 FBXO24O75426 580 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A6P12236 298 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 FOXE3Q13461 319 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 AARDQ4LEZ3 155 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 PRR13Q9NZ81 148 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 WSB1Q9Y6I7 421 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PN81 502 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 G3V318 75 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 CHRNA7P36544 502 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 CITED1Q99966 193 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 NSG2Q9Y328 171 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0G2JRQ6 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GU03 582 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 TEX22C9J3V5 150 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 BRI3O95415 125 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 IFNA21P01568 189 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-218ENST00000525459 OPN1MWP04001 364 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms