RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DYNLT3P51808 116 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BDP58876 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FXYD4P59646 89 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR2B8PP59922 312 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 UBE2KP61086 200 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SSTP61278 116 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FGF12P61328 243 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PCBD1P61457 104 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BCP62807 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CCL20P78556 96 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DRB3P79483 266 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF92Q03936 586 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TLE4Q04727 773 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 KIR2DS1Q14954 304 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HERPUD1Q15011 391 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HAGHQ16775 308 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SP6Q3SY56 376 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RAET1LQ5VY80 246 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PLCXD3Q63HM9 321 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A45Q8N413 288 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RAB40CQ96S21 281 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 P2RX4Q99571 388 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RARRES2Q99969 163 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 BCL2L14Q9BZR8 327 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR2H1Q9GZK4 316 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CALHM2Q9HA72 323 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 THYN1Q9P016 225 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 Q9UF83 564 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 LIPGQ9Y5X9 500 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 U3KQA8 63 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 THADAQ6YHU6 1953 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SPTBP11277 2137 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 A0A0G2JRQ6 117 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 A0A0J9YW62 118 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CLDN34H7C241 214 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TNFSF11O14788 317 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R2P9O14990 202 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 YIF1AO95070 293 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SOD3P08294 240 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CCL3P10147 92 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 COX6A1P12074 109 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HAAOP46952 286 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SSR4P51571 173 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MLF1P58340 268 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PKIAP61925 76 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SERF2P84101 59 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PSG4Q00888 419 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RUNX1Q01196 453 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ECSCRQ19T08 205 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF429Q86V71 674 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 STX12Q86Y82 276 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.24□□□□□ -1.89
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