RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 IL7P13232 177 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 PI3P19957 117 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 UCP1P25874 307 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 NDPQ00604 133 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF846Q147U1 533 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TREML4Q6UXN2 200 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4A16Q8NH70 328 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 IL22RA2Q969J5 263 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 GALNT14Q96FL9 552 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 USMG5Q96IX5 58 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM56Q96MV1 263 aa11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 G6PCP35575 357 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MYCNOSP40205 109 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 AKR1C2P52895 323 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 BAK1Q16611 211 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1L6Q8NGR2 347 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 C5orf66Q9H5L9 145 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 THYN1Q9P016 225 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PRX2 142 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 CDS2O95674 445 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 AKR1C4P17516 323 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB25P57735 213 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TPPP2P59282 170 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 RUNX1Q01196 453 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC22AQ96IW7 307 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TP53RKQ96S44 253 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 COA4Q9NYJ1 87 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM223BA6NKX1 122 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TRGV3P03979 118 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 LGI3Q8N145 548 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5T1Q8NG75 326 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 DPF1Q92782 380 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MRGPRFQ96AM1 343 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 OR51B2Q9Y5P1 312 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ANK2Q01484 3957 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 C15orf61A6NNL5 157 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFB6O95139 128 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 CRYGCP07315 174 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5AC1P0C628 307 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFA4P12838 97 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2B8PP59922 312 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF429Q86V71 674 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 NECAP1Q8NC96 275 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 GLYATL2Q8WU03 294 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM14BQ9NUH8 114 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 CCL24O00175 119 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 LYRM1O43325 122 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 OR8U8P0C7N1 319 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 PSMB6P28072 239 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 SP6Q3SY56 376 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 ENY2Q9NPA8 101 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms