RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00596Q86U02 117 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8IYB0 196 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 Q96M66 194 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 HINT2Q9BX68 163 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SPTA1P02549 2419 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ATRXP46100 2492 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MLNRO43193 412 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR137BO60478 399 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 DEDDO75618 318 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 BRI3O95415 125 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 HAND1O96004 215 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ADH4P08319 380 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 UCP1P25874 307 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GALR1P47211 349 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LCN2P80188 198 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CDSNQ15517 529 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MSMPQ1L6U9 139 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CST9LP1Q5W188 147 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OSR2Q8N2R0 312 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB1CQ92928 201 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0A6YYD4 124 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ODAMA1E959 279 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SHISA9B4DS77 424 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EQM0 130 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ANGPTL7O43827 346 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZG16O60844 167 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1D-12P01611 117 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CDKN1AP38936 164 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FGF12P61328 243 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 IL13RA2Q14627 380 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 EFNB3Q15768 340 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR157Q5UAW9 335 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZR03 302 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR86Q86TI4 376 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB125Q8N687 156 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01560Q8TB33 94 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 BANF2Q9H503 90 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FZR1Q9UM11 496 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZZEF1O43149 2961 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PP11 408 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 DIRC3C9JPN6 131 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 C1QL1O75973 258 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL20P78556 96 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MSMO1Q15800 293 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 P2RX4Q99571 388 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 RSG1Q9BU20 258 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PARLQ9H300 379 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MANBALQ9NQG1 85 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 DUSP13Q9UII6 198 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 NSG2Q9Y328 171 aa6.02□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CD55P08174 381 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 BCL3P20749 454 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 CFHR2P36980 270 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GATA4P43694 442 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PLP1P60201 277 aa6.02□□□□□ -1.45
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