RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 ZNF585BQ52M93 769 aa16.08■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.08■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 TGP01266 2768 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 TRAV3A0A0B4J244 114 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 E7EUB6 86 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 UPK2O00526 184 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 KRASP01116 189 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 AKAIN1P0CW23 69 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 MYOD1P15172 320 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 S100A5P33763 92 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 TTC9CQ8N5M4 171 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 TERB2Q8NHR7 220 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 COMMD5Q9GZQ3 224 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa16.07■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 SEC14L6B5MCN3 397 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 PRH1P02810 166 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 FGF2P09038 288 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 PI3P19957 117 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 G6PCP35575 357 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 SLURP1P55000 103 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 OR4C16Q8NGL9 310 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 USMG5Q96IX5 58 aa16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 A0A1B0GW64 132 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 NPIPB5A8MRT5 1133 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 DISC1C4P0D8 188 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 PIGPP57054 158 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 RND3P61587 244 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 ZFAND1Q8TCF1 268 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 DCUN1D4Q92564 292 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 SOSTQ9BQB4 213 aa16.05■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 FAM223BA6NKX1 122 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 OVOL1O14753 267 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 OR2B8PP59922 312 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 RHOGP84095 191 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 ZNF45Q02386 682 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 FAM223AQ8IWN6 122 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 OR13C8Q8NGS7 320 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 AKIP1Q9NQ31 210 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 AREGP15514 252 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 ECI1P42126 302 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 COPZ2Q9P299 210 aa16.04■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD34BA5PLL1 514 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 CGB1A6NKQ9 187 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 H0Y980 276 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 DHFRP00374 187 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 SERPINE2P07093 398 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 PSMB6P28072 239 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 ZNF343Q6P1L6 599 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 C19orf35Q6ZS72 473 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 CADM3Q8N126 398 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 NECAP1Q8NC96 275 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 MRGPRFQ96AM1 343 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 PRRT1Q99946 306 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 V9GYH0 126 aa16.03■□□□□ 0.16
NELFE-208ENST00000481121 SNAPC5O75971 98 aa16.02■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 OR2J3O76001 311 aa16.02■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 REG1AP05451 166 aa16.02■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP10-11P60412 298 aa16.02■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 PYDC2Q56P42 97 aa16.02■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 TSC22D3Q99576 134 aa16.02■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 CRYGCP07315 174 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 CTRB1P17538 263 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 ZP3P21754 424 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 ATP5G2Q06055 141 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 CTRB2Q6GPI1 263 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 OR51S1Q8NGJ8 323 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 MRAPQ8TCY5 172 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 SEC22AQ96IW7 307 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 TP53RKQ96S44 253 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 NSG2Q9Y328 171 aa16.01■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 IGLC7A0M8Q6 106 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 IGKV1-39P01597 117 aa16■□□□□ 0.15
NELFE-208ENST00000481121 IGKV1D-39P04432 117 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms