RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 ZNF124Q15973 351 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR4A47Q6IF82 309 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ZNF773Q6PK81 442 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 SULT1C2O00338 296 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 SPRY2O43597 315 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 FAM209BQ5JX69 171 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR2T8A6NH00 312 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 C8orf88P0DMB2 117 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 FCGR2CP31995 323 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 MFAP2P55001 183 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 FXYD4P59646 89 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 GNG2P59768 71 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CNIH2Q6PI25 160 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR5B3Q8NH48 314 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CNBD2Q96M20 576 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 NUPR2A6NF83 97 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 MAS1LP35410 378 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 PLET1Q6UQ28 207 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR2C3Q8N628 320 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 OR51H1Q8NH63 302 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 UPK2O00526 184 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 DHFRP00374 187 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 HRASP01112 189 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CTXN2P0C2S0 81 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TFPI2P48307 235 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 WT1-ASQ06250 92 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 KLK9Q2XQG4 91 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 CXorf58Q96LI9 332 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 HINT2Q9BX68 163 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TMEM140Q9NV12 185 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 BET1LQ9NYM9 111 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 NSG2Q9Y328 171 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.28□□□□□ -1.08
ACTB-209ENST00000473257 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 NOTOA8MTQ0 251 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 F8W735 103 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 DEFB4AO15263 64 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TGOLN2O43493 480 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SLC22A5O76082 557 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 OR13C7P0DN81 318 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.091e-8■■■■■ 33.5
ACTB-209ENST00000473257 BMI1P35226 326 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 APOC4P55056 127 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 ARPC4P59998 168 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PRR20EP86478 221 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PRR20CP86479 221 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PRR20DP86480 221 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PRR20BP86481 221 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PRR20AP86496 221 aa8.27□□□□□ -1.09
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