RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SSR4-208	ENST00000471880	SORL1	Q92673	2214 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TEX22	C9J3V5	150 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880		E7EUB6	86 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	DHFR	P00374	187 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV12-3	P01733	135 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	CD3D	P04234	171 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	AREG	P15514	252 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	G6PC	P35575	357 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ABHD1	Q96SE0	405 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880		S4R3C0	116 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	MARCH11	A6NNE9	402 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	UPK2	O00526	184 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	SNAPC5	O75971	98 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF735	P0CB33	412 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	PI3	P19957	117 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	PSMB6	P28072	239 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF45	Q02386	682 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TATDN3	Q17R31	274 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf32	Q32M92	178 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	NECAP1	Q8NC96	275 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	NSG2	Q9Y328	171 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	RAB3D	O95716	219 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R19	P59542	299 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	OR2B8P	P59922	312 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ACSM6	Q6P461	480 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880		H3BMQ9	156 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	GABARAP	H6UMI1	98 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	BRI3	O95415	125 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINE2	P07093	398 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	SPN	P16150	400 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	MCFD2	Q8NI22	146 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GW64	132 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	CYB5B	O43169	146 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFB8	O95169	186 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TBP	P20226	339 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	UCP3	P55916	312 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	PIGP	P57054	158 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF585B	Q52M93	769 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	COPZ2	Q9P299	210 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	TPPP	O94811	219 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	OR4A16	Q8NH70	328 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	PEMT	Q9UBM1	199 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SSR4-208	ENST00000471880	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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