RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462323.5

MUC4-208, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 5

Gene MUC4, Length 16,197 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-208	ENST00000462323	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	COL4A1	P02462	1669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		A0A1W2PQM1	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	GNB2	P62879	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SYNGR2	O43760	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SRF	P11831	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		A0A1W2PR80	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		H3BRM9	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PRDX4	Q13162	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ITGB4	P16144	1822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		A0A096LPE4	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	DYNLT3	P51808	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	RND2	P52198	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		A0A1W2PQF6	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	C3orf80	F5H4A9	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SYNGR1	O43759	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	WDR54	Q9H977	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF32	P17041	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	IER3	P46695	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CRYBB3	P26998	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	KCNK17	Q96T54	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM187	Q14656	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CFHR2	P36980	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	GNG5	P63218	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		H0YIZ8	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	PDCD1	Q15116	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FGF11	Q92914	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	RPE	Q96AT9	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323		J3QT63	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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