RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PHB2Q99623 299 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 COA4Q9NYJ1 87 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 NSG2Q9Y328 171 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01619G3V211 115 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 GABARAPH6UMI1 98 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR31O00270 319 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2J3O76001 311 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFB8O95169 186 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-23P01764 117 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CD74P04233 296 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CTRB1P17538 263 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 EDN2P20800 178 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 F2RP25116 425 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFSF8P32971 234 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 G6PCP35575 357 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DS2P43631 304 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 UCP3P55916 312 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R46P59540 309 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN5P62079 268 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF343Q6P1L6 599 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D26Q86UD7 250 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 AP3S1Q92572 193 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR25Q96S07 402 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM140Q9NV12 185 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 BET1LQ9NYM9 111 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 S4R3C0 116 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BUA1 57 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 BMPR1BO00238 502 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OVOL1O14753 267 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CTDSPLO15194 276 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 BRI3O95415 125 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 HRASP01112 189 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 KRASP01116 189 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 GHRHP01286 108 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYGCP07315 174 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8U8P0C7N1 319 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 NQO2P16083 231 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MFAP2P55001 183 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R31P59538 309 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2B8PP59922 312 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 CATR1Q13166 79 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK9Q2XQG4 91 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SP6Q3SY56 376 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PYHIN1Q6K0P9 492 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSM6Q6P461 480 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 DPF1Q92782 380 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 DIRAS2Q96HU8 199 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC22AQ96IW7 307 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM68Q96MH6 324 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TP53RKQ96S44 253 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SLA2Q9H6Q3 261 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 HRASLSQ9HDD0 168 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JRQ6 117 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP5D1E7EU14 171 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MPPED1O15442 326 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 TPPPO94811 219 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB3DO95716 219 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-5P01602 117 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 P0C879 139 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PGAM2P15259 253 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-GP17693 338 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMB6P28072 239 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 MAS1LP35410 378 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ECI1P42126 302 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP5CP53041 499 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RND3P61587 244 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOGP84095 191 aa5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms