RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ST20Q9HBF5 79 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 RNF7Q9UBF6 113 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 GREM1O60565 184 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 CD55P08174 381 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 STAG3L3P0CL85 134 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ANOS1P23352 680 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MAGEA5P43359 124 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 SEC11AP67812 179 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 GAGE12BA1L429 117 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 M0QZ24 198 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 HTN1P15515 57 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IL11RAQ14626 422 aa8.32□□□□□ -1.08
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HERC3-202ENST00000402738 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 NPIPB3Q92617 1050 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 LEAP2Q969E1 77 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 SMIM10Q96HG1 83 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 PEX7O00628 323 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MGST3O14880 152 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 CGB1A6NKQ9 187 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MPV17P39210 176 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TMEM186Q96B77 213 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 RAXQ9Y2V3 346 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.31□□□□□ -1.08
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HERC3-202ENST00000402738 A0A0A6YYD4 124 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GUT8 65 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ESDP10768 282 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TSPOP30536 169 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 REG1AP05451 166 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.31□□□□□ -1.08
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HERC3-202ENST00000402738 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.31□□□□□ -1.08
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HERC3-202ENST00000402738 K7EQS6 105 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ID3Q02535 119 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 WBP1LQ9NX94 342 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 C17orf98A8MV24 154 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TNFSF15O95150 251 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TMEM50AO95807 157 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MOSP00540 346 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IGHV2-5P01817 119 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 C3orf79P0CE67 100 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 PKIBQ9C010 78 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 DEPPQ9NTK1 212 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 DOCK1Q14185 1865 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 A0A087X0K7 114 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IFI6P09912 130 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 LGALS7P47929 136 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 CEACAM3P40198 252 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 PRR31Q5SQ13 230 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 AICDAQ9GZX7 198 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 hDV102S1A0JD36 115 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TIMP3P35625 211 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ZNF479Q96JC4 524 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 VCX2Q9H322 139 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 CST9LQ9H4G1 147 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.29□□□□□ -1.08
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