RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 EFNB3Q15768 340 aa15.52■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TEX38Q6PEX7 206 aa15.52■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 MOGAT3Q86VF5 341 aa15.52■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 LEAP2Q969E1 77 aa15.52■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TRAV17A0A0B4J275 112 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SSX2Q16385 188 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 C17orf58Q2M2W7 97 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 CT45A1Q5HYN5 189 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TEPPQ6URK8 271 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 STPG3Q8N7X2 389 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SLC24A4Q8NFF2 622 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 CT45A3Q8NHU0 189 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 LHBP01229 141 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 NPY1RP25929 384 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 OR4A47Q6IF82 309 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TMEM14BQ9NUH8 114 aa15.51■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.5■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 RHOBP62745 196 aa15.5■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TCF23Q7RTU1 214 aa15.5■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TMEM256Q8N2U0 113 aa15.5■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa15.5■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 AHRRA9YTQ3 701 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SELLP14151 372 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 HNF1AP20823 631 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SSTP61278 116 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 IQCJQ1A5X6 159 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 BEND2Q8NDZ0 799 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 C11orf52Q96A22 123 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 C2orf88Q9BSF0 95 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 DSCAMO60469 2012 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 A0A1B0GUS0 222 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 OR4A8P0C604 315 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 RPL29P47914 159 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 ZNF83P51522 516 aa15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 RPL31P62899 125 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 CA2P00918 260 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 COL8A2P25067 703 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 ADMP35318 185 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 THBS3P49746 956 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 K7EN84 100 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 NUPR1O60356 82 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 FOXH1O75593 365 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 RNF224P0DH78 156 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TAS2R60P59551 318 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SEM1Q6ZVN7 128 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 MISP3Q96FF7 219 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TANC2Q9HCD6 1990 aa15.48■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 WT1P19544 449 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 PRR20EP86478 221 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 PRR20CP86479 221 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 PRR20DP86480 221 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 PRR20BP86481 221 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 PRR20AP86496 221 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 RAB31Q13636 194 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 ITLN1Q8WWA0 313 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 ENY2Q9NPA8 101 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 FKBP11Q9NYL4 201 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 MT-CO2P00403 227 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 RAB4BP61018 213 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 FAM201AQ5SY85 155 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 NEUROG1Q92886 237 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 RAB9BQ9NP90 201 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 IL36BQ9NZH7 164 aa15.47■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 C9JCJ5 164 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 M0R1B8 84 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 SPRY3O43610 288 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 MYOD1P15172 320 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 NDUFB7P17568 137 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 IGFBP2P18065 325 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 ALKBH2Q6NS38 261 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 OR4P4Q8NGL7 312 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 FNDC10F2Z333 226 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 LINC00869P0C866 280 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 POU2AF1Q16633 256 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 FAM222BQ8WU58 562 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 LY96Q9Y6Y9 160 aa15.46■□□□□ 0.07
CBX1-202ENST00000393408 LOC400499M0QZD8 3231 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms