RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 FAM215AQ9Y5M1 114 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 DVL1O14640 695 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 OR5R1Q8NH85 324 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 PDLIM4P50479 330 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 SELENOVP59797 346 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 GAMTQ14353 236 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 C1orf185Q5T7R7 199 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 FAM78BQ5VT40 261 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 TEPPQ6URK8 271 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 C1orf159Q96HA4 380 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 DERL1Q9BUN8 251 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 SVILO95425 2214 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 AMBPP02760 352 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 NUBP1P53384 320 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 SSTP61278 116 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 STUMQ69YW2 141 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 IGFL3Q6UXB1 125 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 C14orf144Q96I85 54 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 FUT9Q9Y231 359 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXD13-201ENST00000392539 RAB31Q13636 194 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 LYG1Q8N1E2 194 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 SSMEM1Q8WWF3 244 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 GCM1Q9NP62 436 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 POU2AF1Q16633 256 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 REC114Q7Z4M0 266 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF439Q8NDP4 499 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM37Q8WXS4 190 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 IL19Q9UHD0 177 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 RHOBP62745 196 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 CHODLQ9H9P2 273 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 IL3RAP26951 378 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM144Q7Z5S9 345 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 GAFA1Q96PS6 74 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 CADP27708 2225 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 FNDC10F2Z333 226 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TSTD3H0UI37 97 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 CA2P00918 260 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 C1QTNF9P0C862 333 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 GCHFRP30047 84 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TIMP3P35625 211 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 RPL29P47914 159 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 FOXL1Q12952 345 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM30BQ3MIR4 351 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 RPRMLQ8N4K4 120 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 STPG3Q8N7X2 389 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 SFRP2Q96HF1 295 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM204Q9BSN7 226 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 IGHV1-46P01743 117 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 EFNB3Q15768 340 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF114Q8NC26 417 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 MT-CO2P00403 227 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TNFSF4P23510 183 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TCF23Q7RTU1 214 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 CORO2AQ92828 525 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00574Q9H8X3 128 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 PRNDQ9UKY0 176 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 OR51B2Q9Y5P1 312 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 PAX1P15863 534 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 SFXN3Q9BWM7 321 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 A0A0U1RQK1 487 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 SCO2A0A1W2PP80 73 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF320A2RRD8 509 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TM4SF5O14894 197 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 DDTP30046 118 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB108BQ8NET1 73 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 NEUROG1Q92886 237 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 PGPEP1LA6NFU8 196 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 GNG10P50151 68 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 RPL15P61313 204 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF788Q6ZQV5 615 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZS92 163 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 CCL13Q99616 98 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXD13-201ENST00000392539 HINT2Q9BX68 163 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 DYSFO75923 2080 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 CNN1P51911 297 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 GZMBP10144 247 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 PRR20EP86478 221 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 PRR20CP86479 221 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 PRR20DP86480 221 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 PRR20BP86481 221 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 PRR20AP86496 221 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD13-201ENST00000392539 SGMS2Q8NHU3 365 aa21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms