RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 RLN1P04808 185 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CRYGCP07315 174 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 RPA2P15927 270 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 LPAR6P43657 344 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TAS2R19P59542 299 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 MEF2DQ14814 521 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 SPCS2Q15005 226 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 SSX9Q7RTT3 188 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52I2Q8NH67 350 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 THYN1Q9P016 225 aa6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 MARCH11A6NNE9 402 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TEX22C9J3V5 150 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CTDSP2O14595 271 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CTDSPLO15194 276 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 S1PR2O95136 353 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CD74P04233 296 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFA4P12838 97 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMB6P28072 239 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 ECI1P42126 302 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 SLURP1P55000 103 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2B8PP59922 312 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 RND3P61587 244 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 RPEL1Q2QD12 228 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5B3Q8NH48 314 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TERB2Q8NHR7 220 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 ABHD1Q96SE0 405 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 GPHA2Q96T91 129 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM140Q9NV12 185 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 PEMTQ9UBM1 199 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 KLK11Q9UBX7 282 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 PRNDQ9UKY0 176 aa6.54□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TENM3Q9P273 2699 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 HMX3A6NHT5 357 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 DISC1C4P0D8 188 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 H0Y980 276 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB3DO95716 219 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 KRASP01116 189 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CD3DP04234 171 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPINE2P07093 398 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 APELAP0DMC3 54 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 PGAM2P15259 253 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CTRB1P17538 263 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 IL18Q14116 193 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 C15orf32Q32M92 178 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF585BQ52M93 769 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 ISOC1Q96CN7 298 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 CXorf58Q96LI9 332 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM56Q96MV1 263 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6V0BQ99437 205 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 B9D2Q9BPU9 175 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.53□□□□□ -1.36
MT-TS1-201ENST00000387416 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 H3BMQ9 156 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 M0QYG6 137 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2J3O76001 311 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF45Q02386 682 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 CD69Q07108 199 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 LAX1Q8IWV1 398 aa6.52□□□□□ -1.37
MT-TS1-201ENST00000387416 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.52□□□□□ -1.37
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