RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 TIMM23O14925 209 aa12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A17O43808 307 aa12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 RAB13P51153 203 aa12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 SSX2Q16385 188 aa12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 FBLN7Q53RD9 439 aa12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM170AQ8WVE7 144 aa12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 ATP5SQ99766 215 aa12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 AIFM2Q9BRQ8 373 aa12.36□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 APCP25054 2843 aa12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 RRHO14718 337 aa12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 FGF16O43320 207 aa12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 ATP6V0CP27449 155 aa12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 RUNX1Q01196 453 aa12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 HNF4GQ14541 408 aa12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC12BQ2HXU8 276 aa12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 OR10W1Q8NGF6 305 aa12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 PRNDQ9UKY0 176 aa12.35□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 IFNA10P01566 189 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 SPP1P10451 314 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 COMMD7Q86VX2 200 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 HIPK2Q9H2X6 1198 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 LGALS7P47929 136 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 RPL8P62917 257 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 PAX8Q06710 450 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 SLC38A11Q08AI6 406 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF266Q14584 549 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 RNF141Q8WVD5 230 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 CFHR4Q92496 578 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 CLCC1Q96S66 551 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 AUP1Q9Y679 476 aa12.34□□□□□ -0.43
CASQ1-201ENST00000368078 F2RL1P55085 397 aa12.33□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 LGALS4P56470 323 aa12.33□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 PSG5Q15238 335 aa12.33□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 C10orf55Q5SWW7 151 aa12.33□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 THNSL2Q86YJ6 484 aa12.33□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 LILRB2Q8N423 598 aa12.33□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 AJUBAQ96IF1 538 aa12.33□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 REG4Q9BYZ8 158 aa12.33□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CGB1A6NKQ9 187 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 VENTXO95231 258 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CRYGBP07316 175 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 FGF2P09038 288 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SEC11BP0C7V7 166 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 USF1P22415 310 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CEACAM3P40198 252 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 FHITP49789 147 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SULT1A2P50226 295 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2E1P51965 193 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 HBG1P69891 147 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 HBG2P69892 147 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 PRCDQ00LT1 54 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 STPG2Q8N412 459 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 OR2G3Q8NGZ4 309 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 COMMD5Q9GZQ3 224 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa12.32□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GW64 132 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 DFFBO76075 338 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1D-33P01593 117 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1-33P01594 117 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 DSCR9P59020 149 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 VMA21Q3ZAQ7 101 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 OR10P1Q8NGE3 313 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 RSG1Q9BU20 258 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 FBXL15Q9H469 300 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ENY2Q9NPA8 101 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 FKBP11Q9NYL4 201 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 NAV3Q8IVL0 2385 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 FCN1O00602 326 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CA2P00918 260 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 IFNA5P01569 189 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A24Q6NUK1 477 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 OR4A5Q8NH83 315 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 VSTM2AQ8TAG5 236 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CACFD1Q9UGQ2 172 aa12.31□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa12.3□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 OR8U8P0C7N1 319 aa12.3□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 CD1BP29016 333 aa12.3□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa12.3□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 ETV3LQ6ZN32 361 aa12.3□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 TEX45Q8NA69 505 aa12.3□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHA3Q9HB20 300 aa12.3□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CASQ1-201ENST00000368078 SIGLEC9Q9Y336 463 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms