RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 CRYBB3P26998 211 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 NUP37Q8NFH4 326 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 H3BTX0 84 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 UCP1P25874 307 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 CX3CL1P78423 397 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 LY6DQ14210 128 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM177Q53S58 311 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 GALNT14Q96FL9 552 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-202ENST00000366197 PROB1E7EW31 1015 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 M0R3E3 92 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 CA2P00918 260 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV1D-33P01593 117 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV1-33P01594 117 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 CA7P43166 264 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 DUX5Q96PT3 197 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 H0YL77 283 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 HLA-DQA1P01909 254 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 MOSP00540 346 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 CD99P14209 185 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ANOS1P23352 680 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 CD81P60033 236 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 C2orf83Q53S99 150 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 C5orf52A6NGY3 159 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 MEOX2P50222 304 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 IFT22Q9H7X7 185 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 A0A0G2JK05 382 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 TBX15Q96SF7 602 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 SIPA1L1O43166 1804 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ARID2Q68CP9 1835 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 GCGP01275 180 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 RND3P61587 244 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 C17orf98A8MV24 154 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 KLK2P20151 261 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 DLX6P56179 175 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 SGK494Q96LW2 274 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 RRHO14718 337 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 OR4A47Q6IF82 309 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 IFITM10A6NMD0 228 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 CCL3L1P16619 93 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 RPRMQ9NS64 109 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 PIEZO1Q92508 2521 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 SIAH2O43255 324 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 DANCRP0C864 163 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 PINLYPA6NC86 204 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 UBE2L6O14933 153 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV3-20P01619 116 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 TRGC1P0CF51 173 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-202ENST00000366197 SMUG1Q53HV7 270 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms