RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 UNC13CQ8NB66 2214 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 OR10S1Q8NGN2 331 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 KIR2DL4Q99706 377 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 FBLIM1Q8WUP2 373 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TGFAP01135 160 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 CEACAM1P13688 526 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TCF24Q7RTU0 167 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 DUX3Q96PT4 197 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV3-11P01762 117 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 POC1AQ8NBT0 407 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TFF3Q07654 80 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM30BQ3MIR4 351 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 Q5BKY6 102 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 BIVMQ86UB2 503 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 DPM3Q9P2X0 92 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 FAM209AQ5JX71 171 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf106Q8NAJ2 232 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 C17orf98A8MV24 154 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF708P17019 499 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 IGFBP2P18065 325 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 FABP2P12104 132 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 RAB9AP51151 201 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 CLDND2Q8NHS1 167 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 GAGE10A6NGK3 116 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 OR10AG1Q8NH19 301 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 MRAP2Q96G30 205 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TEX45Q8NA69 505 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 ARPC1AQ92747 370 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TNFSF10P50591 281 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV24A0A0B4J272 114 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 EFEMP2O95967 443 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 UCP3P55916 312 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 WDR82Q6UXN9 313 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 SCN4AP35499 1836 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 CGAP01215 116 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 SOD3P08294 240 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM160Q9NX00 188 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 TFF1P04155 84 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 DANCRP0C864 163 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 COTL1Q14019 142 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 IFI27L2Q9H2X8 130 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 FOLR2P14207 255 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 C18orf15Q96N68 181 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 C19orf24Q9BVV8 132 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 NPCDR1Q9BY65 106 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 ARID1AO14497 2285 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 SCN2AQ99250 2005 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 WDYHV1Q96HA8 205 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 OR11H4Q8NGC9 324 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 PSG7Q13046 419 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM101Q96IK0 257 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 OR4X2Q8NGF9 303 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 DMRTA2Q96SC8 542 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 UMODP07911 640 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 ASIPP42127 132 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 PMCHL1Q16048 86 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 LTBRP36941 435 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 LINC01587Q99440 93 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM170BQ5T4T1 132 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 J3QW42 95 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf68Q2NKX9 166 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 COLCA1Q6ZS62 124 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC13O75165 2243 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 TM4SF5O14894 197 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF883P0CG24 379 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 LY6DQ14210 128 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 CD24P25063 80 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-DRB1P01911 266 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 CCL3L1P16619 93 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 CBLN1P23435 193 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 HBBP68871 147 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 GLMPQ8WWB7 406 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 C21orf62Q9NYP8 219 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 NBEAP1P0C6P0 100 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A34Q6PIV7 304 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-201ENST00000332175 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms