RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 SOD3P08294 240 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 ALKBH2Q6NS38 261 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 CCL13Q99616 98 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 NIT2Q9NQR4 276 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 DCAF16Q9NXF7 216 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 FABP1P07148 127 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 CT45A6P0DMU7 189 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 CT45A5P0DMU8 189 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 CT45A7P0DMV0 189 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 TNFSF4P23510 183 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 DOLPP1Q86YN1 238 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 CD99P14209 185 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 LYG1Q8N1E2 194 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 F6UZH7 168 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 HRASP01112 189 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 IGHV2-70P01814 119 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 TYMSP04818 313 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 THBDP07204 575 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 BMP5P22003 454 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 NPY1RP25929 384 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 NBL1P41271 181 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 ATP5G3P48201 142 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 PRR20EP86478 221 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 PRR20CP86479 221 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 PRR20DP86480 221 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 PRR20BP86481 221 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 PRR20AP86496 221 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 ADIPOQQ15848 244 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 PYY3Q5JQD4 70 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 MIC13Q5XKP0 118 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 LINC01551Q86U37 167 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 KLK10O43240 276 aa11.27□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 PRCDQ00LT1 54 aa11.27□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.27□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 OR4X1Q8NH49 305 aa11.27□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
ATG4C-201ENST00000317868 DPRXA6NFQ7 191 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 UPK2O00526 184 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 CXorf1O96002 111 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 GALR1P47211 349 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 RPL29P47914 159 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 Q8NA96 180 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 PRNDQ9UKY0 176 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 C17orf100A8MU93 164 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 H7BYZ3 331 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 CA2P00918 260 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 SRP14P37108 136 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF596Q8TC21 504 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 BET1LQ9NYM9 111 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 ATMQ13315 3056 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1W2PPV4 95 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 LINC00587B1AMM8 73 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 DNLZQ5SXM8 178 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 TEPPQ6URK8 271 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 MIOXQ9UGB7 285 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 OR51B2Q9Y5P1 312 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 hADV38S2A0JD32 116 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 IGKV1-16P04430 117 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 MYOD1P15172 320 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 S100PP25815 95 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 CHODLQ9H9P2 273 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 TNCP24821 2201 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 C16orf97H3BN30 126 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 PPP1R2P9O14990 202 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 TNFRSF1AP19438 455 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 GNG10P50151 68 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 EFNB3Q15768 340 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 SSX8Q7RTT4 187 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 STPG3Q8N7X2 389 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 DEFB108BQ8NET1 73 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 IMMP2LQ96T52 175 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 LINC00869P0C866 280 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 DERL1Q9BUN8 251 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 IRF2P14316 349 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 PDLIM4P50479 330 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4C-201ENST00000317868 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms