RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 CST9LQ9H4G1 147 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 RAX2Q96IS3 184 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ALG1L2C9J202 215 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 CT83Q5H943 113 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 KLK8O60259 260 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 GAGE12JA6NER3 117 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 BGLAPP02818 100 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 GAGE1Q13065 139 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 GAGE4Q13068 117 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 GAGE5Q13069 117 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 GAGE6Q13070 117 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.68□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 NTN1O95631 604 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 UBE2V1Q13404 147 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 MMD2Q8IY49 270 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0G2JLM5 398 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ATP6V0BQ99437 205 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 CXCL12P48061 93 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 SYNGR1O43759 233 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM238C9JI98 176 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 PATE1Q8WXA2 126 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC01387J3KSC0 135 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 NRN1Q9NPD7 142 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 MLNRO43193 412 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 PRSS23O95084 383 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 VENTXO95231 258 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A087WUJ7 227 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 RPRMQ9NS64 109 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 H3BTX0 84 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 IGLV3-27P01718 113 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 RPL34P49207 117 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 MMP25Q9NPA2 562 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1B0GUT8 65 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ODAMA1E959 279 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF83P51522 516 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 MS4A5Q9H3V2 200 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 TDGF1P3P51864 188 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM42Q69YG0 159 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF774Q6NX45 483 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 CTLA4P16410 223 aa9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 HIGD1CA8MV81 97 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 COL10A1Q03692 680 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 PSG1P11464 419 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 PGPA6NDG6 321 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 K7N7A8 449 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 PRRT4C9JH25 899 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 MGST3O14880 152 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 IGLV3-25P01717 112 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 ADMP35318 185 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 TFPI2P48307 235 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 DPTQ07507 201 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM186Q96B77 213 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 FOXB1Q99853 325 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 FGF22Q9HCT0 170 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 CLEC1BQ9P126 229 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0A6YYD5 115 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 IRF3Q14653 427 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 PMS2CLQ68D20 193 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 SPRED2Q7Z698 418 aa9.65□□□□□ -0.86
HDGFL3-201ENST00000299633 SPSB2Q99619 263 aa9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms