RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 LCN2P80188 198 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 COQ2Q96H96 371 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 DKK4Q9UBT3 224 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PSG11Q9UQ72 335 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ATMQ13315 3056 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FCN1O00602 326 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 HBZP02008 142 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TCL1AP56279 114 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 C15orf62A8K5M9 175 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 K7EN84 100 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TNFSF13O75888 250 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 BRS3P32247 399 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 MMDQ15546 238 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ATOH7Q8N100 152 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR9G9P0C7N8 305 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 STARD4Q96DR4 205 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OOEPA6NGQ2 149 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 VAMP8Q9BV40 100 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 CACNA1GO43497 2377 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 YPEL1O60688 119 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TIMP3P35625 211 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 YPEL2Q96QA6 119 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PROCRQ9UNN8 238 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 AHRRA9YTQ3 701 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TCF21O43680 179 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ACTL6BO94805 426 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FXYD3Q14802 87 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 BTF3L4Q96K17 158 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 RNF212BA8MTL3 300 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SNURFLB1AK76 121 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 IGLV1-44P01699 117 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TPPP2P59282 170 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXL1Q12952 345 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 NINJ1Q92982 152 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM122AQ96E09 287 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PDE6DO43924 150 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FCGR3BO75015 233 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PMCHP20382 165 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 EDDM3AQ14507 147 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ATP6V1FQ16864 119 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 CGAP01215 116 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 R3HDM4Q96D70 268 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 DUSP13Q9UII6 198 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MGAQ8IWI9 3026 aa14.71□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 P0C879 139 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 TREML4Q6UXN2 200 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CD177Q8N6Q3 437 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 PRR7Q8TB68 274 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC29Q8WV35 223 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 RCHY1Q96PM5 261 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 SFTPCP11686 197 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 PCP4P48539 62 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MAJINQ3KP22 176 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 DOLPP1Q86YN1 238 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MGST2Q99735 147 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MSMPQ1L6U9 139 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 TMPRSS2O15393 492 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms