RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 A0A1B0GW15 77 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 ARPC1AQ92747 370 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 OR51M1Q9H341 326 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PTP4A3O75365 173 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 AQP3Q92482 292 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 RTN4RQ9BZR6 473 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 CDK2AP2O75956 126 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 IGSF11Q5DX21 431 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 DTX2Q86UW9 622 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 G6PC2Q9NQR9 355 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 C9JCJ5 164 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 SPINK2P20155 84 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 C1QAP02745 245 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 CD69Q07108 199 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 RARRES2Q99969 163 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PARLQ9H300 379 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 FAM206AQ9NX38 181 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 SCTP09683 121 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 ZIC4Q8N9L1 334 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 TMEM160Q9NX00 188 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 USP24Q9UPU5 2620 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 OR1P1Q8NH06 330 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 AICDAQ9GZX7 198 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 KLK13Q9UKR3 277 aa8□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 IGHMP01871 453 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PEX7O00628 323 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 CA7P43166 264 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 DTX1Q86Y01 620 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 MIC13Q5XKP0 118 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 LINC01587Q99440 93 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 IFI6P09912 130 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 SFRP2Q96HF1 295 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 NKX2-8O15522 239 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 GFRA3O60609 400 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 MYOD1P15172 320 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 LCN2P80188 198 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 LY6EQ16553 131 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 A0A0J9YW62 118 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 A1L4Q6 167 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 GP6Q9HCN6 339 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 TDGF1P13385 188 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 FOXC2Q99958 501 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 VWA8A3KMH1 1905 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 FMC1Q96HJ9 113 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 Q6AWC8 147 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PRSS23O95084 383 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PRSS12P56730 875 aa7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 ARF6P62330 175 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 SMIM8Q96KF7 97 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 DUX3Q96PT4 197 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 NEU1Q99519 415 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 MARVELD3Q96A59 401 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 ZNF688P0C7X2 276 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CUX1-201ENST00000292535 TSPAN2O60636 221 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms