RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630224.2

TCF4-269, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 501 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-269	ENST00000630224	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	LHX4	Q969G2	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	RPE	Q96AT9	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-269	ENST00000630224	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		H7C2Y5	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FCGR3B	O75015	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CDS2	O95674	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HOXB5	P09067	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MMP9	P14780	707 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HLA-G	P17693	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	VDAC1	P21796	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	REG1B	P48304	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	AKR1C2	P52895	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RAP2B	P61225	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ERVK-16	P61578	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	KLRD1	Q13241	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		A0A1W2PRD5	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		A0A1W2PRF3	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		A0A1W2PRM7	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		A0A1W2PRX2	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LINC00473	A8K010	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NPFF	O15130	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PROP1	O75360	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	S1PR2	O95136	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CRYZL1	O95825	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HPRT1	P00492	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HRAS	P01112	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NQO2	P16083	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CXCL3	P19876	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	DLX1	P56177	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	BPIFB3	P59826	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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